Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc110Q3V125 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc110Q3V125 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms