Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0P1

Cpxcr1, CPX chromosomal region candidate gene 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpxcr1Q3V0P1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpxcr1Q3V0P1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms