Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Garnl3Q3V0G7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms