Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat1Q3V0C1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms