Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q3UZV7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms