Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms