Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms