Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU21

Gm7534, Predicted gene 7534, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7534Q3UU21 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7534Q3UU21 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7534Q3UU21 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms