Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fchsd2Q3USJ8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fchsd2Q3USJ8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms