Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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