Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rtl4Q3URY0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rtl4Q3URY0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rtl4Q3URY0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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