Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms