Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nhlrc4Q3UP44 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms