Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tmem253Q3UNB8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmem253Q3UNB8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem253Q3UNB8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tmem253Q3UNB8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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