Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN58

Faap20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faap20Q3UN58 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faap20Q3UN58 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms