Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms