Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pin1rt1Q3ULQ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms