Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smu1Q3UKJ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms