Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms