Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms