Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atxn7l3bQ3UD01 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms