Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pid1Q3UBG2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms