Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip13Q3UA06 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms