Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cops9Q3U898 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms