Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp6Q3U6U5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms