Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Fam117bQ3U3E2 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam117bQ3U3E2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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