Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kdm4dQ3U2K5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kdm4dQ3U2K5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm4dQ3U2K5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm4dQ3U2K5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm4dQ3U2K5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Kdm4dQ3U2K5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Kdm4dQ3U2K5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Kdm4dQ3U2K5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kdm4dQ3U2K5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4dQ3U2K5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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