Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pag1Q3U1F9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pag1Q3U1F9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms