Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms