Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hace1Q3U0D9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms