Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms