Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fbxw18Q3TSA9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms