Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms