Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca4Q3TKT4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms