Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp39Q3TIX9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms