Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms