Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms