Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

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Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ap5b1Q3TAP4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ap5b1Q3TAP4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Ap5b1Q3TAP4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ap5b1Q3TAP4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ap5b1Q3TAP4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ap5b1Q3TAP4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ap5b1Q3TAP4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ap5b1Q3TAP4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ap5b1Q3TAP4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5b1Q3TAP4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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