Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms