Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrp1aQ2LKU9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms