Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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