Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tdrd9Q14BI7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd9Q14BI7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms