Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ptchd1Q14B62 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms