Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rpusd3Q14AI6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd3Q14AI6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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