Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q149G0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q149G0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q149G0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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