Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpusd2Q149F1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpusd2Q149F1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Rpusd2Q149F1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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