Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Lingo4Q149C3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Lingo4Q149C3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lingo4Q149C3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms