Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms