Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ttc39dQ0VF76 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ttc39dQ0VF76 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ttc39dQ0VF76 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ttc39dQ0VF76 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Ttc39dQ0VF76 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc39dQ0VF76 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms