Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne7Q0VE82 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms